学校始建于 1912 年，源自近代著名实业家、教育家张謇先生创办的私 立南通医学专门学校和南通纺织专门学校。学校是江苏省人民政府和交通运输部 共建的综合性大学，江苏高水平大学建设高峰计划建设高校。经过一个多世纪的 办学历程，学校已建设成为一所规模结构合理、学科门类齐全、教学质量优秀、 办学效益明显的地方综合性大学。
学校设有 20 个学院、1 个独立学院（杏林学院）、1 家直属大型综合三级甲 等医院（南通大学附属医院）和国际教育学院、继续教育学院。2007 年以优秀成绩通过教育部本科教 学工作水平评估，2017 年高质量通过教育部本科教学工作审核评估。近年来， 学校获国家级教学成果一、二等奖 3 项，形成了一批以国家级一流本科专业建设 点、国家级一流本科课程、国家特色专业、国家级教学团队、国家精品课程、国 家精品资源共享课、国家精品教材、国家级实验教学示范中心、国家级虚拟仿真 实验教学中心、江苏省一流本科专业建设点、江苏省品牌专业等为代表的优质教 学资源。学校是全国普通高等学校毕业生就业工作先进集体、全国高等学校创业教育 研究与实践先进单位、江苏省首批创新创业示范高校、江苏省首批教学工作先进 高校。学生年均总就业率保持在 98%以上。
学校拥有基础医学、临床医学、信息与通信工程 3 个博士后流动站，基础医 学、临床医学、信息与通信工程、公共卫生与预防医学、特种医学 5 个一级学科 博士点，23 个一级学科硕士点，19 个硕士专业学位点。临床医学、神经科学与 行为学、工程学、药理学与毒理学、生物学与生物化学、化学、材料科学、分子 生物与遗传学、计算机科学等 9 个学科进入 ESI 学科全球排名前 1%。拥有江苏 高校优势学科 2 个、江苏省重点学科 8 个、江苏省临床医学重点专科 30 个。
高校编制、发布《本科教学质量报告》，是开展自我评估、健全质量保障体系、完善信息公开制度的一项重要工作，是增强社会责任意识、回应社会关切的体现，也是向社会展示学校风貌和办学特色、宣传办学理念和教学成果的途径。
近期，学校发布2022-2023学年本科教学质量报告，
详情如下：
（注：报告数据截至2023年8月，就业率为初次就业率。到了年底，年终就业率、升学人数，还会有明显提升。）
2022-2023 学年，全日制在校生总数36459 人，本科生人数30204人，本科生占全日制在校生的比例为 82.84%。
2022 年招生专 业数 77 个，涵盖文学、理学、工学、医学、艺术学、经济学、法学、教育学、 历史学、管理学等 10 个学科门类。有全日制在校本科生 42000 余人，全日制在 校研究生 5200 余人，留学生 1000 余人。
2022-2023 学年测试结果显 示，我校参加国家学生体质健康标准测试的共计 28507 人， 全校合格率达到 97.02%。
学校应届本科生的毕业率、学位授予率均稳定在较高水平。2023 届本科生 毕业率为 97.84%，学位授予率为 95.72%。
