据南沙产业园管理局，香港科技大学（广州）项目二期工程已经正式启建。目前二期工程现场正在开展土方平整、软基处理以及施工围蔽、驻地等临时设施建设工作。
二期工程位于广州市南沙区庆盛枢纽片区西北角，总建筑面积约73万平方米。项目聚焦“教育+科研+产业”深度融合，主要建设内容包括：产学研大楼（知识转移转化中心）、教学综合体、科研大楼、NFF纳米实验室及动力站、学生宿舍与书院、停车楼、科研活动中心、全海洋动力实验室、校门诊部、教师宿舍、配套服务用房、配套幼儿园、学术交流中心及学术礼堂以及人防工程、地下室、架空层、连廊、室外停车场、室外运动场及室外工程等。教学综合体和产学研大楼严格按三星绿色建筑标准设计，彰显低碳发展理念。
项目设计融合“东方派、中国风、岭南韵、国际范”理念，采用岭南传统布局与清水湾校园轴线式风格，既体现地域文化特色，又契合国际化学府定位。
二期工程将重点突破微纳制造、海洋动力等“卡脖子”技术领域，打通从实验室到生产线的创新链条，成为大湾区科技创新的“新引擎”。
