2026年，我校共有62个本科专业、22个专科专业面向全国29个省、市、自治区招生，计划招收普通本科、专科学生7818人，其中本科4400人，专科1300人，专升本2118人。
2026年度，经教育部批复，同意我校与白俄罗斯国立农业学院合作设立非独立法人中外合作办学机构-菏泽学院中白农业技术与工程学院。机构办学采用“4+0”双学位培养模式，开设设施农业科学与工程、智慧水利、机械电子工程三个本科专业。每个专业计划招生100人，纳入国家普通高等学校招生计划，严格执行国家统一招生政策。学生4年在菏泽学院完成学业并达到双方毕业及学位授予条件后，可同时获得菏泽学院的学历、学位证书以及白俄罗斯国立农业学院相应专业的毕业证书（含学位）。
今年我校继续面向省内招收“物理学”师范类中外合作办学本科专业学生，学制4年。该专业采用“3+1”培养模式，前三年在菏泽学院培养，第四年学生自愿赴白俄罗斯戈梅利国立大学留学，毕业获得菏泽学院本科学历、学位和戈梅利国立大学毕业证书（含学位）。在此期间，学生可申请菏泽学院普通学生奖助学金和戈梅利国立大学专项奖学金。
